Наряду с лечебной и научной деятельностью, госпиталь занимается подготовкой молодых специалистов. НМИЦ ВМТ имени А.А. Вишневского имеет государственную аккредитацию на осуществление образовательной деятельности и готовит врачей по программам ординатуры на базе Военно-медицинского института Национального медицинского исследовательского центра имени А. А. Вишневского.