В 3 урологических отделениях госпиталя (общей урологии, онкоурологии, уролитиаза) за год выполняется более 1200 операций по поводу различных урологических заболеваний. Коечная емкость урологического центра – 75 коек.

Начальник урологического центра заслуженый врач РФ, кандидат медицинских наук, врач высшей категории, полковник медицинской службы Ситников Н. В. В урологическом центре работают 6 кандидатов медицинских наук, подготовлены к защите две докторские диссертации. Ежегодно Выходят в центральной медицинской печати научные публикации (статьи и тезисы).
Значительное и превалирующее количество пациентов оперируется по поводу доброкачественной гиперплазии (аденомы) предстательной железы (ДГПЖ), мочекаменной болезни, онкоурологических заболеваний. Урологический центр госпиталя оснащен современной медицинской аппаратурой, имеет большие технические вазможности для выполнения любой сложности урологических вмешительств.
В отделении уролитиаза имеется два аппарата для дистанционной литотрипсии в почках и мочеточниках (ДУВЛ) – ЛитУРАТ, «EDAP», а также аппаратура для выполнения контактного дробления камней в мочеточниках и мочевом пузыре (контактных литотрипсий) – «Litoclast»,»Kandella». Также центр оснащен средствами для выполнения контактного чрескожного дробления и удаления камней из почек любых размеров – перкутанной нефролитотрипсии. Лишь небольшому количеству пациентов выполняются открытые операции при мочекаменной болезни.

По поводу онкоурологических заболеваний выполняются следующие виды операций:

Рак мочевого пузыря – трансуретральная резекция (ТУР) стенок мочевого пузыря с опухолями с пересадкой мочеточника при вовлечении последнего в опухолевый процесс, удаление мочевого пузыря (цистектомия) с различными видами отведения (деривации) мочи и формированием нового (артифициального) мочевого пузыря из различных сетментов кишечника.
Рак предстательной железы – радикальная простатэктомия, ТУР простаты, биопсия простаты для верификации диагноза, двусторонняя орхидэктомия с целью максимальной андрогенной блокады.
Рак почки – радикальная, расширенная нефрэктомия, органосохраняющие операции (резекция почки, энуклеации опухолевых узлов)
Рак яичка – орхофуникулэктомия с последующим проведением химиотерапии, лимфаденектомия при метостазах в лимфоузлы.

В отделении общей урологии и других урологических отделениях по поводу ДГПЖ (аденомы простаты) проводятся операции – ТУР аденомы простаты, ТУР – вапоризация аденомы простаты, чреспузырная аденомуктомия, троакарная цистостомия. Также выполняются другие операции при различных урологических заболеваниях (варикоцеле, водянка оболочек яичка, фимоз, парафимоз, стриктура уретры, абсцессы почек, простаты, кисты почек). По поводу кист почек выполняются – открытые операции на почках при сложных и гигантских кистах, лапароскопичесие резекции стенок кист почек (сложные, многокамерные кисты, парапельвикальные кисты), пункции кист почек со склерозированием кистозной полости и стенок кисты. При варикоцеле выполняются «открытые» операции, а также склеротерапия с помощью рентгеноваскулярных методик.
В урологическом центре госпиталя проводится лечение заболеваний простатовезикулярного комплекса с помощью современных методов.